L'élevage est presque toujours accompagné de mauvaises odeurs et d'un nombre important de mouches en raison de l’apparition de processus de putréfaction. En combinaison avec les émissions élevées en ammoniac, cela peut entraîner une nuisance olfactive ainsi qu'un véritable fléau. L'utilisation de la technologie EM dans la nourriture, les bâtiments d'élevage et l’engrais organique permet de prévenir les processus de putréfaction avant même qu’ils ne surviennent. L'air ambiant dans le bâtiment est amélioré, les mouches et les odeurs sont fortement diminuées.